Oui, ça tient au fait que le relatif mineur d'une gamme majeure correspond au sixième degré. (Quand tu fais te gamme majeure, si tu pars de la sixte, ça fait la gamme mineure naturelle)
Donc le relatif majeur de la pentatonique mineure tu l'as une tierce mineure (3 demi-tons) plus haut comme l'a dit SamyBgood.
Après si c'est le fait que le majeur est inclus dans le mineur et inversement qui te perturbe, en fait ça dépend comment tu fais sonner ta pentatonique. Avec une pentatonique mineure de La, si jamais tu retombes sur le La souvent sur les temps, ça fera clairement mineur. Mais si tu joues souvent sur le Do et que t'utilises les intervalles de tierces majeures, ça sonnera différemment, mais pas pour autant faux. En fait tout dépend du contexte et de ce que tu veux faire passer, il vaut mieux que tu ailles toi même explorer toutes les possibilités de la pentatonique.